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研究人员首次为海蛇尾开发了元条形码技术。由广岛修道大学和东京大学的 Masanori Okanishi 博士领导的科学家分析了水中海洋无脊椎动物释放的环境 DNA (eDNA),并成功确定了他们正在寻找的物种。该研究发表在开放获取期刊Metabarcoding and Metagenomics上。
元条形码允许研究人员根据环境 DNA(即释放到特定湖泊水中的 DNA)轻松快速地识别物种并确定它们在给定位置的数量。
这种方法已成功用于通过对一桶水进行采样来检测海洋特定位置的物种数量。监测物种是保护生物资源和维护其经济价值的工作的一部分,元条形码可以作为一种劳动密集度较低、成本效益更高的工具用于生物多样性的海洋调查。
这项新研究报告了研究小组开发的第一个用于海蛇尾元条形码编码的 DNA 引物。海蛇尾是棘皮动物门中最丰富的物种(约 2,100 种),这使它们成为环境 DNA 元条形码编码的有前途的指示生物。由于这些海洋无脊椎动物体型庞大、种群众多,并且栖息在各种海底环境中,因此被认为会释放出丰富的环境 DNA。
为了确定从样本中获得并用于元条形码编码的 DNA 序列的来源,Okanishi 的团队根据相模湾 60 种海蛇尾物种的标本构建了一个参考 DNA 序列数据库。
到目前为止,元条形码还没有用于海蛇尾等流动性很小的生物体,因为许多参考 DNA 序列被错误识别或未被识别。新数据库将有助于该技术的进一步研究和应用。
“如果通过开发额外的引物和更丰富的参考 DNA 序列数据库,元条形码成为可能,那么就可以以前所未有的精确度监测海洋环境,”作者总结道。